В статье представлен опыт совместной работы градоэкологов и онкологов по внедрению новых методов выявления и профилактики злокачественных новообразований в г. Саратове на основе данных комплексных геоэкологических исследований с использованием геоинформационных технологий. Рассмотрены структура и содержание картографических баз данных специализированной медико-географической ГИС, позволяющей создавать карты канцерогенной ситуации, проводить на их основе скрининговые исследования и разрабатывать рекомендации для онкологов и врачей других специализаций.